В 2008—2009 годах Айдын Али-заде был привлечен к судебному разбирательству в России. Все началось с того, что 16 марта 2007 года в исторической мечети Самары распространялась статья «Праздник Новруз и исламская доктрина», автором которой был он. Эта статья написана еще в 2001 году и была взята с его сайта www.islam.boom.ru, который он вел в те годы.

В статье рассказывалось о происхождении этого праздника, который празднуется на Ближнем и Среднем Востоке, а также проводились параллели с исламским богословием. Несмотря на то, что статья была сугубо познавательной, ФСБ Самарской области усмотрело в ней признаки разжигания межнациональной и религиозной вражды и направило дело в суд с заявлением о признании сайта www.islam.boom.ru экстремистским, и о прекращении его деятельности.

Первоначально решением суда этот сайт был закрыт. Однако дело рассматривалось около года, в течение которого были назначены три экспертизы. В конце

концов судья Самарского районного суда города Самары Ольга Кривицкая отказала в иске прокурору о признании экстремистским текста брошюры Айдына Али-заде «Праздник Новруз и исламская доктрина» и сайта «Ислам как он есть» (www.islam.boom.ru). Судья решила, что прокурор не смог доказательно обосновать свою позицию. Айдына Али-заде на этих судебных разбирательствах представлял адвокат Рустем Валиуллин.

Несмотря на то, что на суде было доказано отсутствие экстремизма на сайте «Ислам как он есть» www.islam.boom.ru, тем не менее, Айдын Али-заде не стал обращаться к администраторам этого ресурса для его открытия и этот сайт прекратил свое существование.

Этот судебный процесс был первым в череде дальнейших процессов по запрету некоторых признанных судами экстремистскими исламских книг, публикаций и интернет-ресурсов в России, на протяжении нескольких последующих лет.

2008—2009-cu illərdə Aydın Əlizadəyə qarşı Rusiyanın Samara şəhərində məhkəmə işi aparılmışdır. Bu işin səbəbi də 16 mart 2007-ci ildə Samara məscidində onun “Novruz bayramı və İslam qanunları” adlı məqaləsinin yayılması olmuşdur.

Məqalənin yalnız məlumat xarakterli olmasına baxmayaraq, Samara vilayətinin təhlükəsizlik orqanlarının (FSB-nin) nümayəndələri orada milli və dini ayrıseçkiliyin əlamətlərinin olduğunu iddia etmiş və işi məhkəməyə yollamışdırlar.

Məhkəmədə bu işə uzun müddət baxılmış və məsələlərə aydınlıq gətirmək üçün 3 dinşünaslıq ekspertizaları təyin olunmuşdur. Ancaq sonda Aydın Əlizadə bəraət qazanmışdı. Hakimin fikrincə prokuror öz ittihamını əsaslandıra bilməmişdir.

Bu məhkəmə işi o zaman Rusiya mətbuatı tərəfindən izlənilirdi, bu barədə analitik məqalələr yazılmış, müsahibələr alınmışdır.

Aydın Əlizadənin məhkəmə işindən sonra Rusiyada bir neçə il ərzində bir çox müsəlman yayım evlərinə və internet-saytlarına qarşı məhkəmə işləri açılmış, onların bir çoxu ekstremist elan olunmuş, fəaliyyətləri dayandırılmışdır. Bu məhkəmələr silsiləsində Aydın Əlizadənin işi birinci idi.